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2012年 / アメリカ
The CW遭難事故の後、孤島での地獄のような日々を送ったオリバーは奇跡的に故郷に帰還。死の間際に父から託された街の悪人たちに制裁を加えるべく、夜になると弓矢を手に緑のフードをかぶったダークヒーロー「アロー」として街へと繰り出す。誰にも正体を明かさずに孤独な戦いを続けていたオリバーだったが、用心棒だったジョンと、家族が経営する会社のIT担当フェリシティという仲間を得る。ある日、自分の母親が街に潜む大きな陰謀に関わっていることを知り、破滅の危機に直面している街を救うべく、仲間とともに動き出す。
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2008年 / アメリカ
FOXボストン国際空港に自動着陸した機内では、乗員・乗客全員の肉体が溶け落ち骨だけになっていた。FBI捜査官のオリビア・ダナムは、相棒スコット捜査官と共に捜査に加わる。すると捜査上にウォルター・ビショップ博士という、フリンジ・サイエンス(非主流科学)の天才博士の名が浮き上がる。しかし、博士は17年間ある施設に収容されており、博士に相談できる唯一の手段は、疎遠になっていた博士の息子のピーターに協力を頼むことだった。IQ190の天才ピーターをなんとか説き伏せ、オリビア、ウォルター、ピーターの3人は事件を追う。そして、死のフライトで起きた事が、さらに巨大で衝撃的な真実の氷山の一角に過ぎないと知るのだった…。